為貫徹落實黨中央國務院關于加快推進現代農作物種業發展要求，財政部、農業農村部、農發行、中化集團于2012年11月聯合發起設立現代種業發展基金，目標募集金額50-80億元，采用基金公司與新投資人設立子基金、原股東增資等方式擴大募集規模。2013年1月，現代種業發展基金有限公司（以下簡稱種業基金）注冊成立。截至目前，種業基金規模25億元。其中：財政部出資10億元，持股比例為39.69%；農發行出資15億元，持股比例為60.31%。
種業基金是國內種業領域首支具有中央政府背景、實行市場化運作的政府引導基金，根本宗旨是貫徹落實黨中央國務院種業發展決策部署，聚合產業資本、金融資本和社會資本，服務國家種業振興戰略。其投資方向：不低于募集資本80%的資金用于種業領域投資，其余用于農業領域其他投資。投資范圍：以農作物種業為重點，逐步向畜禽水產等領域拓展。投資方式：采取包括普通股、優先股、可轉債等方式，投資參股大型農作物種業集團、專業化種業企業、服務型種業企業，通過發揮基金的引領和聚集作用帶動社會資本投入，壯大種業企業的資金實力，提升種業企業市場競爭力。
種業基金成立以來，在財政部、農業農村部、農發行的悉心指導和強力支持下，投資進展順利、社會效益顯著，創新了財政支農方式，已成為我國種業發展不可或缺的支持力量。種業基金先后被評為中國農業領域投資機構10強、中國現代農業領域股權投資機構20強，并當選中國種子協會副會長單位。
打好種業翻身仗，加快推進種業振興，是一項長期任務、系統工程。習近平總書記2021年7月9日主持召開中央深改委會議，審議通過《種業振興行動方案》，把種源安全提升到關系國家安全的戰略高度，要求集中力量，破難題、補短板、強優勢、控風險，實現種業科技自立自強，種源自主可控，明確要求更好地發揮種業基金的職能作用。
種業基金堅決貫徹落實黨中央國務院關于現代種業發展的方針政策，將在各股東方、發起方強力支持下，充分發揮農發行政策性金融系統優勢，積極推動“投貸聯動、投投聯動”機制落實，加大同業合作力度，有效發揮政府引導及財政資金杠桿作用，帶動更多社會資本投資種業領域，全力服務種業振興。
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